AIDD 增量简报 · 2026-10-04

以 10-01 版为基线的 diff ｜检索窗口 2026-09-24 → 10-04 ｜中英双语 15 轮

增量 diff 开源算法与平台国内外趋势生信岗位可执行

一句话结论：「没有结构」第一次从「结构模型的补丁」升级为一条独立技术路线。三条互不相关的证据同周落地：Talus Bio 的 Ptarmigan-1 直接跳过折叠做全蛋白组对接（10 ms vs 54 s，约 5000×）；MRC-LMB 的 GuideFlip 针对「只有结合了才有结构」的固有无序蛋白做出 13.5% / 41.7% / 75% 三个湿实验命中率；CODesign 用 10.5 万条一致性蒸馏二聚体把 in-silico 成功率推高 70.9%。与此同时评测层第二次公开翻转已有结论（Nature Biotech：校准指标下 DL 扰动模型确实打得过朴素基线），而 agent 层第一次出现系统性负证据（专业化 system prompt 反而 −10.0 pp 且贵 2.2–4.5 倍）。

本周数字 ①

10 ms vs 54 s

Ptarmigan-1 与 Boltz-2 单化合物打分耗时（约 5000×）——「绕开结构」第一次有了可引用成本数字

本周数字 ②

−10.0 pp

专业化 agent system prompt 在 60 道工具调用型生信题上相对极简基线的差距（46.7% vs 56.7%）

本周数字 ③

19%

Bepirovirsen pooled III 期功能性治愈率（233/1220 vs 0/614），PDUFA 10-26

图 1｜本轮三条独立证据。① 与 ② 打的是同一类靶点但路线相反（一个用数据绕开结构，一个让结构在设计中涌现）；③ 是在有结构范式内用「一致性」把协同设计推到 SOTA。对 caiPro 的可迁移点是 ② 的「每步重预测、让当前状态影响下一步」这一推理时框架。

§1 上版 10 项追踪回执

#	上版追踪项	状态	本轮回执
1	Anthropic×Adaptyv Challenge 1（10-04 首窗关闭）+ Track 3 格式	✅ 回执	首窗 09-28 → 10-04 于今日关闭；5 题每周一题至 10-31，实验 11-30 前完成，数据 12-15 全公开 Proteinbase（含阴性）。资源口径仍三版本 → 继续写「合计约 200 万美元量级」。P0 条款 Section 3.1 禁赛名单含 China（Track 3 唯一通道）已多源确认。但 Track 2 已有中国团队入选线索（PeptAI）→ Track 2 是否对境内开放值得单独核一次
2	VCC 10-22 公开榜 → 11-05 截止	⏳ 部分回执	Arc 发布 2026 数据集博文：赛制从 2025「单细胞系 few-shot」跳到「六条细胞系 zero-shot 跨上下文泛化」（参赛者只拿到未扰动转录谱做输入）；六条细胞系按组织来源 / 谱系 / 疾病状态三条轴选；QC 指标显著优于公开 Perturb-seq
3	Bepirovirsen PDUFA 10-26	✅ 重大回执	见 §2.3 —— 日期确认、pooled 三期数字全部补齐、日本 2026-08 已获批（全球首个慢性乙肝功能性治愈方案）
4	OpenBind 后续版本 + OB0 第三方复现	❌	未检索到新进展，转入季度观察池
5	siProGenA 仓库（第 5 轮）+ ClinASO 实测	❌	顺延（第 6 轮）
6	FDA 非临床规则是否因反对撤回	❌	顺延（本轮未专项检索，诚实标注）
7	《生物安全法案》生效原文	❌	顺延（本轮未专项检索，诚实标注）
8	国家数据局医疗细则 + 江苏数据集开放申请	✅ 重大回执	见 §6.2 —— 国家数据产权登记服务系统已上线（`sjcqdj.nda.gov.cn`），首批 56 份凭证、三权分置、六统一、三家交易所入全国目录
9	时安 SA030 首例给药 / SA1211 Phase 1b	⚠️ 部分	临床读数仍未检索到；融资侧补齐：时安 A+ 轮约 4 亿元（08-20，IDG 资本 / 阳光融汇 / 元生创投 / 蓝驰创投 / 华泰紫金 / 国投招商 / 中启资本），A 轮系列合计近 4 亿元
10	Ginkgo×OpenAI coopetition sfGFP 首轮	❌	顺延

§2 本轮最硬的三条

2.1Ptarmigan-1：把「可成药」的前提从「有没有结构」改成「有没有相互作用映射」★ 本轮最高价值

来源：Talus Bio 官方发布（2026-10-01，BusinessWire）+ 智药局中文拆解（10-02）。公司 = 西雅图 Talus Bioscience，CEO Alex Federation（哈佛化学生物博士，Jay Bradner 门下，MARMOT 化学蛋白质组平台主要发明人），CTO Lindsay Pino（UW 基因组科学博士，前 Broad）。

维度	硬数字 / 事实
定位	第一个不需要蛋白三维结构的 AI 制药模型；只输入蛋白序列 + 化合物 SMILES
做法	蛋白序列编码器 + 配体 SMILES 编码器 → 同一 256 维潜在空间；训练目标 = 真实结合的分子与残基在空间里最近。筛选从「逐对模拟」变成「一次建图、反复查询」
分辨率	残基级（能指出结合在哪个区域），不只是「是否结合」
训练数据	化学蛋白质组学 + 生物活性数据，含活细胞内环境下的活性位点测量（MARMOT 平台自产）
速度	单张 H100 上单化合物打分 10 ms；同任务开源共折叠模型 Boltz-2 约 54 s → 约 5000 倍
规模	单靶点筛 100 万化合物：从接近 2 年压到 3 小时内；20 张 H100 × 约 1 天完成 34 亿化合物 × 20,431 个人类蛋白互筛（仅约 20 H100 GPU 小时）
LIT-PCBA	仅次于 Boltz-2 排第二，优于 Glide-SP / Gnina 等传统对接
最难的一条（盲测）	训练集中刻意剔除的 STAT6 转录因子专利抑制剂系列：Ptarmigan-1 得分约 0.94，结构方法基线约 0.58（接近随机）；第三方实验室验证到新化学分子结合 STAT6 柔性口袋。KRAS G12C 相关分子能按研发代际排序 → 提示学的是相互作用规律而非记忆
靶点空间	约 40% 人类蛋白组缺乏可供建模的稳定结构（转录因子、调控蛋白）；7 月预印本：约 2 万人类蛋白中 87% 既无获批药物也无强效小分子配体

⚠️ P0 判读：这是「开放访问」，不是「开源」

模型权重与代码均未公开，只能通过 ptarmigan.app 门户使用，限制 单次 ≤1 万个化合物、每天 10 次筛选。中文源已明确指出「属于开放访问而非开源」。不要把 Ptarmigan-1 写进开源选型表。

★ 对 chen 的映射（P1）：这条与上版 OpenBind 的「模型学的是空间位置不是化学」是同一结论的正面版本 —— 当你没有可靠结构时，用相互作用数据（化学蛋白质组 / 细胞内外源测量）直接建序列-化合物映射，比硬凑一个结构更划算。caiPro 的 siRNA 场景里，「序列 ↔ 实测敲低效力」的映射同样是可在无结构条件下建立的。

2.2GuideFlip：为「结合了才有结构」的靶点做 binder，湿实验三个命中率

来源：bioRxiv DOI 10.64898/2026.09.27.754145（2026-09-27），MRC 分子生物学实验室（LMB），一作 Kai Yi，通讯 Sjors H. W. Scheres + Kiarash Jamali。

方法：guided discrete flow matching 协同设计结构与序列 —— binder 残基逐个指派，每一步都重新预测复合物，让正在形成的界面反过来影响后续设计。这降低了直接 AlphaFold 优化的疏水偏好。
湿实验命中率（本轮最硬的一组）：α-synuclein 羧基端（固有无序）13.5%；RBX1 无序氨基端 41.7%（表位经 NMR + 突变验证）；构象选择性纳米抗体（只结合激动剂结合的 β1AR 活性态、不结合非活性态）75%，并有 3.3 Å 冷冻电镜结构确认设计（EMD-59993 / PDB 34KK）
开放程度：代码 MIT（github.com/ykiiiiii/GuideFlip）；177 个人类无序蛋白的 binder 候选数据库已放 HuggingFace；无利益冲突声明

★ 对 chen：GuideFlip 的「每一步都重预测，让当前状态影响下一步」是一个可直接迁移到序列设计的推理时框架（对照上版 MIMOSA 的「推理时注入已知约束」）。且 MIT 许可 + 已放候选库，是可直接下下来跑的少数几个。

2.3Bepirovirsen：PDUFA 10-26 前的完整底牌（ASO，非 siRNA）

项	硬数字
药物 / 机制	ASO（反义寡核苷酸），靶向 HBV 转录本促进 RNA 降解；GSK + Ionis
PDUFA	2026-10-26（2026-04 受理 + 优先审评 + 突破性疗法 + 此前快速通道）
日本	2026-08 已获厚生劳动省批准，成为日本首个用于慢性乙肝功能性治愈的方案
试验	B-Well 1 + B-Well 2，两项设计相同、29 国、2:1 随机、每周 300 mg 皮下 × 24 周，主要终点第 72 周
主要终点（pooled）	19%（233/1220）vs 安慰剂 0%（0/614），P<.001；B-Well 1 20%、B-Well 2 19%
关键次级终点	基线 HBsAg ≤1000 IU/mL 亚组（约占全球确诊 CHB 的 45%）功能性治愈 26%（200/768 vs 0/393）
其他	停药后 HBV DNA 低于 LLOQ 23%（283/1220 vs 0/614）；一年后 qHBsAg ≤100 IU/mL 49%
安全性	以注射部位反应与一过性肝酶升高为主，无新安全信号
背景 / 发表	现有核苷（酸）类似物需终身服药，功能性治愈 <1%；NEJM 同期发表 + EASL 2026-05-28 报告

⚠️ P1 判读

19% / 26% 是「功能性治愈」而非「完全清除」，且安慰剂组 0% 说明终点极严。这条对核酸赛道的真实意义是：寡核苷酸第一次在「有限疗程 + 停药后持续控制」这个命题上拿到 III 期确证 —— 这是 caiPro 方案里可直接引用的产业锚点（但请标注是 ASO，不是 siRNA）。

§3 开源算法与平台（本轮新增 · 核心）

3.1本周新增开源清单

名称	许可	是什么 / 关键数字 / caveat
GuideFlip	MIT	固有无序蛋白 / 构象选择性 binder 协同设计（guided discrete flow matching）。α-syn 13.5% / RBX1 41.7% / β1AR 活性态 75% + 3.3 Å cryo-EM；177 个 IDP 候选库已放 HF
CODesign	承诺开源	全原子蛋白 binder 协同设计（joint flow over 序列/骨架/局部原子构型 + 一致性感知联合重采样）。生成约 10.5 万条一致性蒸馏二聚体；消融 +70.9%。⚠️ arXiv 2610.01773（10-01），仓库链接尚未见
Ptarmigan-1	非开源	无结构全蛋白组小分子结合预测（见 §2.1）。明确不要计入开源清单
AZ 阻转异构预测工作流	开放获取	SMARTS 模式匹配识别受限旋转键 + 变溶剂/变温过渡态评估（化学信息学 + QM）。约 30% 近年 FDA 批准药物含潜在阻转异构轴；已用于某肺癌候选。⚠️ 大环仍是公开难点；提供不买商业订阅（Schrödinger）的公开替代
Protein Design MCP v2	Apache-2.0	给 LLM agent 的 41 个原子级蛋白设计工具（`jasonkim8652/protein-design-mcp`）。见 §3.2
Scientific Agents（语料）	开源	503 份职业专属 AGENTS.md 系统提示语料 + 评测（arXiv 2610.00084）。见 §4.2 —— 本轮最重要的负结论
BIABench	数据+代码全开放	16 个真实生物图像分析任务（从已发表研究重建，含科学问题 + 影像 + ground truth）。见 §4.2
M-GoRT	MIT	多目标 de novo 药物设计的 Decision Transformer（return-to-go blocks + goal embedding 条件化）。Bioinformatics `btag731`；无需探索/奖励加权/在线微调；DRD2 / JNK3 高维任务上保持结构多样性与新颖性
Minerva（Stanford）	预印本公开	基因组语言模型驱动的共进化挖掘，挖原核非编码元件。Brian Hie 实验室（David Li + Garyk Brixi），基于 gLM2 + categorical Jacobian + 蛋白接触头；发现 UG27 逆转录酶系统编码一类结构共享、序列多样的 ncRNA 阵列。Kundaje 评述：每个细菌基因组指向数百个新候选元件
磐石科研智能生态 1.0 中科院计算机网络信息中心 09-30	平台	「磐石·壹科学」智能化科研平台 + 生态共建「薪火计划」。三大能力：融合科研要素（数据/模型/工具一体化基座）、互联国家大科学装置与自主实验室全链条、AI4Science 可信评测（覆盖五大学科领域）+ 科技资源标识全链路溯源。光明日报 / 经济日报双源确认
DeepSeek 昇腾六件套 09-30	开源	TileLang-Ascend / TileKernels / DeepGEMM-Ascend / DeepEP-Ascend / FlashMLA / DeepSelect，与 NV 侧接口一一对应。DeepGEMM：BF16 99.8%、FP8 99.5%、FP4 98.3% 硬件上限；DeepEP EP8 dispatch 373–375 GB/s、combine 345–347 GB/s（物理带宽 90–95%）；FlashMLA 昇腾 950 prefill 410 TFLOPS（峰值 95%）、decode 360（83%）；联合推进 128 卡昇腾 950 超节点 UBL128。⚠️ 算子微基准 ≠ 端到端性能，且未声称 V4 全规模训练

3.2一个值得抄的工程决策：Protein Design MCP 把「复合工具」全删了

v2 是一次 breaking change：删掉了 design_binder / predict_complex / predict_structure / analyze_interface / score_stability 五个复合工具。作者给了两条理由，正好是做 agent 工具链的人最容易踩的坑：

复合工具隐藏了决策 —— design_binder 替你选了生成器、序列设计器、结构预测器，agent 拿到的是「一个没法反驳的意见」。v2 改成 41 个 run_* 工具，每个只跑一个引擎，按功能分类（binder_generation 7 / monomer_generation 6 / structure_prediction 11 / msa 2 / scoring 4 …），agent 自己选、并且可以被要求为选择辩护。
design_binder 是错的 —— 它假设了一个不成立的链序，把 target 链当成自己的 design 返回。作者的原文最扎心：「这个 bug 从外面看不见 —— 输出是一个真实蛋白的合法 PDB」。

另两条硬规则：MSA 永远显式提供，绝不在折叠工具内部生成。

对 chen 的映射（P1）：这条和 caiPro / patent-cli 的流水线设计直接相关。凡是「一步跑完、中间决策不可见」的封装，出错时必然是静默的。建议把现有「枚举+打分」管道里所有复合步骤拆成单引擎单工具，并在每个边界上落可审计的中间产物。

3.3物理信息生成模型正在回到主桌（综述锚点）

上海交大医学院张健组在 MedScience 发 Perspective《从物理智能到分子设计：跨尺度机制学习推动药物发现》（科学网 10-03 转发）：核心论点是分子生成不能只学已有数据里的统计规律，必须回到能量、结构、构象变化与分子识别机制本身。梳理的口袋/物理条件化生成模型清单：

LiGANN · FLAG · DeepICL · PocketFlow · DiffSMol · PhoreGen（口袋形状 / 片段模式 / 药效团 / 蛋白-配体相互作用）→ ED2Mol（以电子密度为基础表征，从口袋推断配体密度图再逐步构建分子）。

与上版同向

上版 OpenADMET 的结论是「领域需要 physics-informed 模型，而不只是更多数据」—— 这是两周内第二个独立来源给出同样处方。

§4 评测层：第二次公开翻转，与 agent 层的第一次系统性负证据

4.1Nature Biotech：校准指标下，DL 扰动模型确实打得过朴素基线

Miller, Mejia, Leblanc et al., Nature Biotechnology，2026-10-01 在线，DOI 10.1038/s41587-026-03307-w，OA CC BY 4.0。直接对 2025 年 Ahlmann-Eltze 等（Nature Methods）「DL 扰动模型打不过 PCA+线性回归」做方法学更正。



项 内容

规模 14 个遗传扰动数据集（scPerturb + Zenodo / Figshare / GEO），覆盖 9 项研究、10 种细胞系、激活 + 抑制扰动；18 个指标
核心机制 提出插值重复基线（μ_i,ID = α⊙μ_i,TD + (1−α)⊙μ_all，α = 1−PDEGs）作阳性对照、均值基线作阴性对照，定义 动态范围分数 DRF 度量指标能否区分阳/阴对照
结论 1 常用指标（MSE、Pearson Δctrl）经常未校准，对真实模型性能不敏感
结论 2 加权类 / 排序类指标校准更好：WMSE、加权 R²Δ、归一化逆排序（NIR）
结论 3 在校准指标下，scGPT、GEARS、PRESAGE、scLambda、CellFlow 等多种 DL 模型都能超越无信息基线
防泄漏 每个扰动的细胞固定拆成「真值半 / 技术重复半」
泛化 / 下游 Replogle22 K562、Nadig25 HepG2（未见单扰动）；Norman19、Wessels23（未见组合）；通路富集 + KNN 图秩偏重叠（RBO）


★ 对 chen 的映射（P0）：这就是上版「补朴素基线」的升级版 —— 光有朴素基线不够，还得有阳性/阴性对照来校准指标本身。caiPro 的排序指标（base_pre_score 基于 10nm_score）必须先做一次 DRF 式校准，否则「模型提升了」完全可能只是指标对扰动特异信号不敏感造成的假象。成本 <1 人日，目前性价比最高的一件事。

4.2agent 层第一次出现系统性负证据（本轮最反直觉）
(a) Scientific Agents（arXiv 2610.00084）：503 份职业专属 AGENTS.md，用 Gemini 3.8 Flash 在 Pi harness 里跑，对比「极简基线（You are a helpful assistant）」等四个对照：

项 结果

九个文本类科学基准（4,531 题 / 100 匹配档案） 平均准确率差 −0.6 pp（95% bootstrap [−1.5, +0.2]），无一基准呈现统计显著提升
token 与成本 匹配档案产出 1.5–2.3 倍 token，每次成功调用贵 2.2–4.5 倍
60 道工具调用型 BioMysteryBench 生信题 有档案 46.7% vs 基线 56.7%，差 −10.0 pp（95% [−16.7, −3.3]），主因是更频繁触发 token/时间上限
唯一的意外优势 SuperGPQA 上 provider 掉线时，短基线首次通过仅 54.0% vs 长档案 71.6% —— 但作者指出这来自长度/格式而非领域专业性


(b) BIABench（arXiv 2609.34274）：16 个从已发表研究重建的生物图像分析任务（H&E 到单分子定位显微镜，11 类子任务），同时评「结果分」与「过程分」：

常规 2D 任务解决良好；但只要加上第三个维度或时间轴，没有任何 agent 得分 > 0.19
生物学专精、更强模型、详细专家指令，都填不上这个坑
可靠性问题最严重：同一 agent 重复运行之间的分数差异，大于不同 agent 之间的差异；且没有 ground truth 时，无法从过程分或耗时上区分一次正确运行和一次错误运行

(c) 相关基准：Terminal-Bench-Science 0.1（Stanford × Terminal-Bench，70 道终端任务，GPT-6 Astra 68.10）；Terminal-Bench 4.0（66 道新任务，科学 14 道，中位专家工时 4 小时，严格按最终产物判分，avg@3）。

★ 对 chen 的映射（P0）—— 本周最该读的两条
如果你正在给 caiPro 或 patent-cli 加 agent 层：①长 system prompt 默认全量加载是负收益，应改成按需检索片段；②任何 agent 输出都必须跑 ≥3 次报方差，单次结果置信度接近于零；③没有 ground truth 的过程分不可信 —— 别用「看起来很专业」当验收标准。


§5 产业 / 资本

事件 硬数字 / 事实

华深智药 B 轮 7.87 亿美元，2026 年全球生物技术最高单笔融资纪录。投资方 DST Global / Sanofi / Dimension / 渶策 / 高瓴 + 辉瑞 Biotech Development Fund / Luminous / Miracle / Sanofi Ventures。清华 AIR 孵化，创始人 彭健（RaptorX、OmegaFold；2016 斯隆奖、2020 ISCB Overton 奖），联创 朱祯平（前诺华副总裁）。⚠️ 工商变更记 2026-03-25 vs 媒体「赛诺菲合作后不久」→ 只写「2026 年 B 轮 7.87 亿美元」
Earendil Labs × 赛诺菲
华深海外主体 2026-01 潜在总额最高 25.6 亿美元，首付 + 近期里程碑最高 1.6 亿美元；AI 发现平台设计双抗，赛诺菲负责开发与全球商业化。赛诺菲既是合作方又是股东
元思生肽 Synova × AZ 首付 5500 万美元，含近期里程碑合计最高 7500 万美元。大环肽；联创张骁（前易凯资本合伙人）、高欣（KAUST 教授，首席 AI 官）
Anew Labs（字节系）首轮 2.9 亿美元，投后 15 亿美元，字节保留约 56%。红杉中国 / IDG / 高瓴领投，中国生物制药、上海未来产业基金参与。底层源于字节已开源的 Protenix / PXDesign；AAI 2026 披露全球首个全谱 IL-17 小分子抑制剂（覆盖 AA/AF/FF 三亚型），已进 IND 申报准备
英矽 × 元羿生物（Tenacia） 扩展合作，总交易金额最高 9475 万美元（10-02 公告）；生成式 AI 共开发 CNS 候选分子至 PCC
德睿智药 MDR-001 × 三生蔓迪/万晟 中国内地 + 港澳独家商业化，潜在总额最高 17.5 亿元人民币（09-28）；MDR-001 口服小分子 GLP-1 正在中国做 III 期
时安生物 A+ 轮 约 4 亿元（A 轮系列合计近 4 亿元），08-20；IDG 资本 / 阳光融汇 / 元生创投 / 蓝驰创投 / 华泰紫金 / 国投招商 / 中启资本等
国内 AI 制药前 9 月 57 笔 / 44 家 / 157.65 亿元，超 2023–2025 三年总和（2025 全年 51 亿的 3.1 倍）；单笔中位数升至 1.2 亿元。最高 4 笔（华深 / Anew / 元思生肽 1.5 亿美元 / 寻明生科 1 亿美元）合计约 95 亿元，占六成
英矽 H1 总收入约 1.063 亿美元（+287%），经调整净利 >5100 万美元，上市后首个盈利半年度；12–18 个月 / 300–500 万美元产出 PCC，为传统 1/4–1/5
AIVC 商业化最清晰收入验证 Noetik × GSK：5000 万美元预付款买 OCTO-VC 模型访问权并按订阅持续付费，用少量自有数据微调 —— 制药企业第一次为「细胞层面的预测能力」付账，而不是为某一个分子付账
Turbine Simulated Cell，lab-in-the-loop；MSD / AZ / 拜耳用过其虚拟检测，累计服务 >30 个发现项目；2026-02 2500 万美元 B 轮
国内 AIVC 百曜科技 AURA CellOS（LLM-JEPA，训练于 3.905 亿人类单细胞转录组，40+ 组织 / 260+ 细胞类型，2026-06 数千万元新一轮，国新创投领投）；百图生科 × 华大智造（2026-09 战略合作，百图出 xTrimo 2680 亿参数模型、华大出跨组学仪器与规模化数据产能）
罗氏自动化实验室 约 20 亿瑞郎（24.1 亿美元）研发结余重配；AI 自动化实验室已启动建设（Lab in the Loop）；Target Nexus 2026 年底前参与 80% 研究组合决策；III 期成功率 65% → 80%+；2025Q4–2026Q2 40% 管线决策有可追踪 AI 支持；2030 前最多 20 个 NME。Aviv Regev：目标是让 AI 在药物研发中实现独立
英矽 LabClaw
官方稿确认 Agent-Guard 架构；5 个协作式 agent（实验协调者 / 实验编排专家 / 科学分析专家 / 质量控制监察 / 数据专家）+ 28 个专业技能模块；封装 20 个可组合实验步骤模块 + 8 套标准化实验计划模板；部署于 LifeStar2（6 大功能岛、AGV 跨岛流转、7×24）。整合 PandaOmics + LIMS + 多维分析管线；关键节点 human-in-the-loop 审批。⚠️「吞吐量 +40–50%」「相当于 50 人团队」来自 live-blog 注入源，不作事实引用
海淀「科学发现自主实验室」 09-28 开工，规划建筑面积约 1 万平方米，2027 年底竣工；四大核心自主实验室 = 有机合成 / 药物发现 / 合成生物学 / 智能表征 + 智能仪器研发验证展示中心。中关村（海淀）AI4S 创新集聚区核心项目，海国投旗下伦睿科技运营，面向高校/院所/企业提供公共科创服务
Agentic 实验室平台全景 Recursion 每周最多 220 万次实验（公司自述，仅自用不接受订单）；Lila Sciences 自 2025 累计融资 5.5 亿美元；Insilico LabClaw 仅内部；XtalPi 300+ 工作站。⚠️ 除 AIntibody（Nat Biotechnol 盲测同行评审）外，几乎所有数字都是公司自述、无第三方审计
Monte Rosa MRT-8102 NEK7 分子胶降解剂，GFORCE-1 I 期（10-01）：4 周 hsCRP 中位降 85%，94% 受试者 CRP < 2 mg/L；5–400 mg 下外周 T 细胞 NEK7 降解 约 80–90%



§6 政策 / 监管

6.1国际

FDA 首设「技术与人工智能副局长」（2026-09-08，HHS 宣布）：Jared Seehafer（Enzyme 联合创始人兼前 CEO，2025-08 加入 FDA 任政策办公室高级顾问；USC 医疗器械与诊断工程硕士）。这是 FDA agency-wide 的副局长级职位，高于各中心主任，意味着 AI 治理从「各中心各自为政」升为跨中心优先级。同日确认 CDER 主任 Michael Davis、CBER 主任 Karim Mikhail、CTP 主任 Bret Koplow。
⚠️ 配套背景：药品警告信同比激增 59%，其中一部分 FDA 直接归因于 GMP 环境中不恰当的 AI 使用。→ 「AI 上产线」的合规风险已经实际发生，不是理论问题。
印度 SAHI + BODH（AI Impact Summit 2026）：SAHI = Secure AI for Health Initiative，国家路线图（治理 / 数据管理 / 验证标准 / 监测）；BODH = IIT Kanpur × 国家卫生局共建的医疗 AI 基准测试开放数据平台，用匿名真实数据在不转移、不暴露底层患者数据的前提下评估性能、鲁棒性、偏倚与泛化。WHO 东南亚区办公室公开肯定。
FDA × EMA《药物开发中人工智能良好实践指导原则》十条原则（延续）与 FDA 09-08 设 AI 副局长构成同一周的监管双动作。
美国 50 亿美元「Genesis 计划」连接 17 个国家实验室（二手源待核）。


6.2国内

十五五《医药工业发展规划》原文确认（十部门）：第 8 条 = 建设医药行业高质量数据集、打造医药健康可信数据空间、加快研发医药垂类大模型与智能体；专栏 6「AI 制药高价值应用场景培育」四项 = ①智能靶点筛选与药物发现（含动物模型数据挖掘、中医药人用经验数据挖掘、实验室数据集成管理、辅助临床试验方案审评）②智能制药与质量管理（全流程数据自动采集与追溯系统）③智能医药使用及健康管理（数字孪生 + 高仿真虚拟患者模型）④智慧药械生产流通监管（「两品一械」审评审批检查大模型与智能体）。配套：2027 前 AI4S 普及率 70%、2030 超 90%（国务院「人工智能+」行动，二手源待核原文）。
国家数据产权登记服务系统上线（sjcqdj.nda.gov.cn）：2026-09-11 试运行，首日 56 份数据产权登记凭证公示（与 AI 应用相关的 >15 份，其中医疗卫生 6 个）。制度内核 = 三权分置（持有权 / 使用权 / 经营权） + 六统一（统一登记对象 / 类型 / 流程 / 审查标准 / 效力 / 系统），实现「一次登记、全国通用」。依据：国家数据局 2026-07《数据产权登记工作指引（试行）》。首批登记机构目录：北京国际大数据交易所 / 上海数据交易所 / 深圳数据交易所。
⚠️ 口径冲突（P1）
首批发放日期有三个版本 ——「09-11 系统上线首日公示 56 份」「09-21 正式陆续发放」「上版记的 09-22 首批」→ 引用只写「2026 年 9 月，首批 56 份」。
中科院磐石科研智能生态 1.0（09-30，见 §3.1）；南京全国首个省级 AI4S 公共算力中心（08-30 揭牌，二手源待核）。
企业侧表态（十五五解读）：康方生物「AI 辅助靶点筛选与抗体设计，候选分子发现周期缩短近 40%」；华大集团尹烨提出「生物超级智能自主未来实验室」构想；恒瑞在分子设计筛选、临床前、临床、药学开发全方位加大 AI 投入。


§7 核酸侧

项 内容

Bepirovirsen 见 §2.3（ASO，PDUFA 10-26，日本已批）
瑞博生物「AI+siRNA」 09-22 全资子公司瑞博泰克（山东）自动化智能药物筛选中心落成：自动化机器人集群 + 智能化数据分析底座，适配小核酸早期发现与临床前，与公司现有 AI 辅助研发体系深度打通，实现算法模型与高通量湿实验的数据互通与实时迭代。现有 7 款临床阶段资产、20 余项临床前、45+ 早期项目；肝靶向成熟、肝外递送已获重要突破。董事长梁子才：「小核酸药物具备数字化设计的天然属性」。H1 收入 41.97 亿元（+304.3%）
瑞博 vortosiran 全球首创 FXI siRNA，欧洲 IIa 完成，FXI 活性最大降幅 92%；2026-04/05 分别向 EMA 递交房颤与 VTE 的 IIb 期临床申请（投资者口径，待公司公告核）
兴普泰生物 8 亿元多肽 + 小核酸原料药扩建项目备案；小核酸产线覆盖 ASO + siRNA，产能 100 kg/年。已获 Chemical Space 技术平台正式授权，把 AI 分子设计与筛选接入 CRDMO
时安生物 A+ 轮约 4 亿元；代谢稳定碳水化合物靶向配体专利（09-11 公开）—— 肝外递送的配体侧布局
siRNA 赛道口径 1 期到获批成功率约 64% ≈ 行业均值 5.7% 的 11 倍（二手源，与上版 Alnylam 自述 >60% 口径不一）→ 建议统一引「Alnylam 自述 >60%」并注明来源
RNASeek 上版已确认权重放 HF（JoyXiangLab/rnaseek-full）；本轮 bioRxiv full-text 上线（10.64898/2026.09.24.754173），三段式 pretrain→predict→GRPO 细节完整，仍是与 caiPro 结构同构度最高的可参考样板



§8 岗位信号（本轮 5 条 JD）

岗位 薪资 / 地点 关键要求原文

AI 算法专家（化学方向 AIDD） 30–50k × 14 薪 / 北京 / 5–10 年 / 博士 主职责含「规划多模态分子/反应表征、预训练、多任务学习和任务微调方案」「基于 LLM/Agent 整合 AI 模型、CADD/计算生物学工具、专家知识库与研发流程，建设 Copilot 能力」「规划并建设模型训练与推理平台及 MLOps 机制，覆盖数据与模型版本管理、实验追踪、评估、部署、在线/离线推理及运行监控」「系统评估模型的准确性、泛化能力、鲁棒性、可解释性和适用边界，并以可量化的业务价值或实验结果作为项目验收依据」
AI / ML 算法专家（AI4S / AIDD） 40–65k / 北京 / 5 年+ 「参与论文、开源项目及技术成果建设」进岗位职责；要求「在顶级会议期刊发表过有影响力的研究成果，或参与过有影响力的开源项目」
AIDD 研究员（丽珠，09-29） 12–20k / 珠海 / 硕士 传统 CADD 为主（PyMOL / AutoDock / MOE / Gromacs + DeepChem），「了解 GNN、Transformer」
扬州某 AI 算法工程师 未标 / 1–3 年 / 本科 对照岗：模型压缩、推理加速、Docker、量化/剪枝 —— 工程化要求在低线城市岗位里也已标配
猎头岗（AI4S 方向） 40–65k 明确 Foundation Model / Generative AI / Diffusion / Transformer 在 AI for Science / AIDD 的应用



共性维度统计（本轮 5 条）

维度 命中 趋势

干湿闭环 / 数据-模型-评估-实验反馈迭代 4/5 连续第 12 轮 ≥80%
可复现工作流 / MLOps / 平台工程 3/5 上版 4/5，仍在高位，已从加分项稳定进主职责
评测体系 / 误差分析 / 适用边界 3/5 上版 3/5，持平
AI Agent / LLM 整合 2/5 上版 3/5
结构预测 2/5 —
开源项目 / 论文成果（新增维度） 2/5 首次进入岗位职责
核酸 / siRNA 0/5 连续第 3 轮算法岗缺席（与 §7 产业侧火热形成背离）



⚠️ P1 判读
核酸算法岗连续三轮缺席，但核酸产业侧（瑞博 / 时安 / 兴普泰 / 前沿 / 石药）在持续加码自动化与 AI。合理解释是核酸 AI 岗位目前以「内部平台化」而非「外部招聘」消化 —— 对 chen 的直接含义：这个方向的竞争不在公开 JD 上，而在谁能拿出端到端可跑的闭环。


§9 对 chen 的可执行动作（按优先级）

# 优先级 动作 依据 成本

1 P0 给 caiPro 的排序指标做一次 DRF 式校准：构造「技术重复基线（阳性对照）+ 均值基线（阴性对照）+ 插值基线」，算每个指标的动态范围分数；MSE / Pearson Δ 先标为「未校准」，改用 WMSE / 加权 R²Δ / NIR Nature Biotech 10-01：同一批模型在未校准指标下输给基线、校准后赢 <1 人日，本轮最高性价比
2 P0 agent 层若已上或计划上：长 system prompt 改为按需检索片段；所有 agent 输出跑 ≥3 次报方差；禁止用过程分当验收标准 Scientific Agents（−10.0 pp / 贵 2.2–4.5×）+ BIABench（同一 agent 重复运行方差 > agent 间差异） 半天
3 P0 把现有「枚举+打分」管道里的复合步骤拆成单引擎单工具，每个边界落可审计中间产物 Protein Design MCP v2：design_binder 把 target 链当 design 返回，输出是合法 PDB 所以从外面看不见 1–2 人日
4 P1 无结构路线评估：如果 caiPro 未来要接「靶点可成药性 / 序列-化合物关联」，优先建序列 ↔ 实测读数的直接映射，别先上结构预测 Ptarmigan-1（跳过折叠，5000×）+ GuideFlip（结构在设计中涌现） 评估 1 天
5 P1 GuideFlip 值得直接下下来跑（MIT + 177 个 IDP 候选库已放）。它的「每步重预测、让当前状态影响下一步」是可迁移到序列设计的推理时框架 §2.2 半天起
6 P1 论文/方案可引的三句：①Nature Biotech「问题在指标不在模型」②Ptarmigan-1「可成药的前提从『有没有结构』改为『有没有相互作用映射』」③张健组「分子设计正从统计相关走向物理机制」 §2.1 / §4.1 / §3.3 0
7 P1 把「开源项目 / 论文成果」写进能力栈目标 —— 本周首次进 JD 主职责（40–65k 岗） §8 长期
8 P2 数据合规台账对标「三权分置」：内部数据集要能说清持有权 / 使用权 / 经营权分别落位，来源授权链条完整 国家数据产权登记制度（§6.2）+ 上版安徽/湖北口径 1 人日
9 P2 昇腾路线可正式评估：DeepSeek 六件套已把算子栈铺平（DeepGEMM BF16 99.8% 硬件上限），但必须用真实负载复测，不能信微基准 §3.1 评估



§10 口径冲突（本轮新增 / 延续）

aidrugsearch.com 连续第 7 轮命中失真源（本轮 3 次）—— 又出现「FDA 2026-03 精准肿瘤 AI 草案要求前瞻性验证」「68% AI 制药公司合规成本上升、平均每辖区 4.2 次申报」「联邦学习降低 PRS 人群偏倚 31%、算力开销 2.7×」等精确但无法在官方文件定位的数字。一律不采用，后续检索显式排除该域。
境外无关域名挂中文 live-blog 注入第 4 轮 —— 本轮命中 mcc-covid.crc.pitt.edu（匹兹堡大学 COVID 官网路径下挂英矽 LabClaw 中文稿）、c-pour-dire.com、keepon.com.tw、agora0.github.io。内容可能为真，但必须回原站核实；LabClaw 官方数字已用富途转载的英文稿交叉确认。
国家数据产权登记首批日期三版本（09-11 / 09-21 / 09-22）→ 只写「2026 年 9 月，首批 56 份」。
华深智药 B 轮日期冲突（工商 2026-03-25 vs 媒体「赛诺菲合作后不久」）→ 只写「2026 年 B 轮」。
「首个不需要结构的 AI 制药模型」是 Talus 自述 —— 严格说是「首个开放门户使用的」，学术上无结构结合预测早已有之。引用时加「公司自述」。
Ptarmigan-1 的 STAT6 / KRAS 数字来自公司预印本、属回顾性验证，第三方实验室验证仅「结合」层面，无功能/细胞数据。
siRNA 成功率两个口径（64% vs Alnylam 自述 >60%）→ 统一引后者并注明。
AI 临床管线口径已达 ≥5 个 → 继续固定引「比率」（I 期 80–90% vs 传统 40–65%；II 期约 40% vs 传统约 37%，无统计学差异；117 个资产仅 8 个通过 II 期）。
bioai-agents.com 目录站：数字多为公司自述（Recursion 220 万次/周、Lila 5.5 亿等），已标注，不作事实引用。


§11 下轮（10-05 及之后）追踪建议

Anthropic×Adaptyv Challenge 2 题目（预计 10-05 前后）+ Track 2 是否真的对境内主体开放（本轮 PeptAI 入选线索，P2 待核）
Bepirovirsen FDA 10-26 决定（是否获批、标签是否限制在 HBsAg ≤1000–3000 IU/mL 亚组）
VCC 10-22 公开榜 → 11-05 截止 → 11 月下旬获奖（关键看点：zero-shot 跨六细胞系设定下，榜首能否显著高出基线）
CODesign 是否真的放出仓库 / 权重 / 10.5 万条蒸馏数据集（本轮只有「will be open-source」承诺）
Ptarmigan-1 是否有第三方前瞻性验证（目前仅 STAT6 的第三方结合验证）
Nature Biotech 校准指标论文的后续：Ahlmann-Eltze 原作者是否回应；VCC 是否采纳 DRF/WMSE 类指标
国家数据局医疗健康行业实施细则 + 江苏「抗体/药效/知识产权」数据集是否开放申请
时安 SA030 中国 I 期首例给药 / SA1211 Phase 1b 读数（第 5 轮）
Ginkgo×OpenAI coopetition sfGFP 首轮（第 2 轮）
十五五配套细则：AI 制药高价值场景清单的落地文件、医药健康可信数据空间试点是否扩大到医药工业

降级为长期观察（不再逐轮占位）：Ortet、北京 1 亿算力首批名单、RIBOSPAN 一手核证、Isomorphic B 轮确切日期、OpenBind OB0 第三方复现（转入季度池）。

顺延：FDA 非临床规则是否撤回、《生物安全法案》原文、ICH S13、ScienceIDE 许可、siProGenA 仓库（第 6 轮）。

本周三个数字

  数字 ①
10 ms vs 54 s
Ptarmigan-1 与 Boltz-2 单化合物打分耗时（约 5000×）——「绕开结构」第一次有了可引用成本数字
  数字 ②
−10.0 pp
专业化 agent system prompt 在 60 道工具调用型生信题上相对极简基线的差距（46.7% vs 56.7%），且贵 2.2–4.5 倍
  数字 ③
19%
Bepirovirsen pooled III 期功能性治愈率（233/1220 vs 0/614）—— 寡核苷酸首次在「有限疗程 + 停药后持续控制」上拿到 III 期确证



生成时间：2026-10-04 ｜ 检索窗口 2026-09-24 → 10-04 ｜ 15 轮中英双语检索 ｜ 基线：2026-10-01 版

本简报为增量 diff，完整背景见 2026-09-08《AIDD 趋势与开源技术全景》与逐日增量简报。

事件	硬数字 / 事实
华深智药 B 轮	7.87 亿美元，2026 年全球生物技术最高单笔融资纪录。投资方 DST Global / Sanofi / Dimension / 渶策 / 高瓴 + 辉瑞 Biotech Development Fund / Luminous / Miracle / Sanofi Ventures。清华 AIR 孵化，创始人彭健（RaptorX、OmegaFold；2016 斯隆奖、2020 ISCB Overton 奖），联创朱祯平（前诺华副总裁）。⚠️ 工商变更记 2026-03-25 vs 媒体「赛诺菲合作后不久」→ 只写「2026 年 B 轮 7.87 亿美元」
Earendil Labs × 赛诺菲华深海外主体 2026-01	潜在总额最高 25.6 亿美元，首付 + 近期里程碑最高 1.6 亿美元；AI 发现平台设计双抗，赛诺菲负责开发与全球商业化。赛诺菲既是合作方又是股东
元思生肽 Synova × AZ	首付 5500 万美元，含近期里程碑合计最高 7500 万美元。大环肽；联创张骁（前易凯资本合伙人）、高欣（KAUST 教授，首席 AI 官）
Anew Labs（字节系）首轮	2.9 亿美元，投后 15 亿美元，字节保留约 56%。红杉中国 / IDG / 高瓴领投，中国生物制药、上海未来产业基金参与。底层源于字节已开源的 Protenix / PXDesign；AAI 2026 披露全球首个全谱 IL-17 小分子抑制剂（覆盖 AA/AF/FF 三亚型），已进 IND 申报准备
英矽 × 元羿生物（Tenacia）	扩展合作，总交易金额最高 9475 万美元（10-02 公告）；生成式 AI 共开发 CNS 候选分子至 PCC
德睿智药 MDR-001 × 三生蔓迪/万晟	中国内地 + 港澳独家商业化，潜在总额最高 17.5 亿元人民币（09-28）；MDR-001 口服小分子 GLP-1 正在中国做 III 期
时安生物 A+ 轮	约 4 亿元（A 轮系列合计近 4 亿元），08-20；IDG 资本 / 阳光融汇 / 元生创投 / 蓝驰创投 / 华泰紫金 / 国投招商 / 中启资本等
国内 AI 制药前 9 月	57 笔 / 44 家 / 157.65 亿元，超 2023–2025 三年总和（2025 全年 51 亿的 3.1 倍）；单笔中位数升至 1.2 亿元。最高 4 笔（华深 / Anew / 元思生肽 1.5 亿美元 / 寻明生科 1 亿美元）合计约 95 亿元，占六成
英矽 H1	总收入约 1.063 亿美元（+287%），经调整净利 >5100 万美元，上市后首个盈利半年度；12–18 个月 / 300–500 万美元产出 PCC，为传统 1/4–1/5
AIVC 商业化最清晰收入验证	Noetik × GSK：5000 万美元预付款买 OCTO-VC 模型访问权并按订阅持续付费，用少量自有数据微调 —— 制药企业第一次为「细胞层面的预测能力」付账，而不是为某一个分子付账
Turbine	Simulated Cell，lab-in-the-loop；MSD / AZ / 拜耳用过其虚拟检测，累计服务 >30 个发现项目；2026-02 2500 万美元 B 轮
国内 AIVC	百曜科技 AURA CellOS（LLM-JEPA，训练于 3.905 亿人类单细胞转录组，40+ 组织 / 260+ 细胞类型，2026-06 数千万元新一轮，国新创投领投）；百图生科 × 华大智造（2026-09 战略合作，百图出 xTrimo 2680 亿参数模型、华大出跨组学仪器与规模化数据产能）
罗氏自动化实验室	约 20 亿瑞郎（24.1 亿美元）研发结余重配；AI 自动化实验室已启动建设（Lab in the Loop）；Target Nexus 2026 年底前参与 80% 研究组合决策；III 期成功率 65% → 80%+；2025Q4–2026Q2 40% 管线决策有可追踪 AI 支持；2030 前最多 20 个 NME。Aviv Regev：目标是让 AI 在药物研发中实现独立
英矽 LabClaw 官方稿确认	Agent-Guard 架构；5 个协作式 agent（实验协调者 / 实验编排专家 / 科学分析专家 / 质量控制监察 / 数据专家）+ 28 个专业技能模块；封装 20 个可组合实验步骤模块 + 8 套标准化实验计划模板；部署于 LifeStar2（6 大功能岛、AGV 跨岛流转、7×24）。整合 PandaOmics + LIMS + 多维分析管线；关键节点 human-in-the-loop 审批。⚠️「吞吐量 +40–50%」「相当于 50 人团队」来自 live-blog 注入源，不作事实引用
海淀「科学发现自主实验室」	09-28 开工，规划建筑面积约 1 万平方米，2027 年底竣工；四大核心自主实验室 = 有机合成 / 药物发现 / 合成生物学 / 智能表征 + 智能仪器研发验证展示中心。中关村（海淀）AI4S 创新集聚区核心项目，海国投旗下伦睿科技运营，面向高校/院所/企业提供公共科创服务
Agentic 实验室平台全景	Recursion 每周最多 220 万次实验（公司自述，仅自用不接受订单）；Lila Sciences 自 2025 累计融资 5.5 亿美元；Insilico LabClaw 仅内部；XtalPi 300+ 工作站。⚠️ 除 AIntibody（Nat Biotechnol 盲测同行评审）外，几乎所有数字都是公司自述、无第三方审计
Monte Rosa MRT-8102	NEK7 分子胶降解剂，GFORCE-1 I 期（10-01）：4 周 hsCRP 中位降 85%，94% 受试者 CRP < 2 mg/L；5–400 mg 下外周 T 细胞 NEK7 降解约 80–90%

项	内容
Bepirovirsen	见 §2.3（ASO，PDUFA 10-26，日本已批）
瑞博生物「AI+siRNA」	09-22 全资子公司瑞博泰克（山东）自动化智能药物筛选中心落成：自动化机器人集群 + 智能化数据分析底座，适配小核酸早期发现与临床前，与公司现有 AI 辅助研发体系深度打通，实现算法模型与高通量湿实验的数据互通与实时迭代。现有 7 款临床阶段资产、20 余项临床前、45+ 早期项目；肝靶向成熟、肝外递送已获重要突破。董事长梁子才：「小核酸药物具备数字化设计的天然属性」。H1 收入 41.97 亿元（+304.3%）
瑞博 vortosiran	全球首创 FXI siRNA，欧洲 IIa 完成，FXI 活性最大降幅 92%；2026-04/05 分别向 EMA 递交房颤与 VTE 的 IIb 期临床申请（投资者口径，待公司公告核）
兴普泰生物	8 亿元多肽 + 小核酸原料药扩建项目备案；小核酸产线覆盖 ASO + siRNA，产能 100 kg/年。已获 Chemical Space 技术平台正式授权，把 AI 分子设计与筛选接入 CRDMO
时安生物	A+ 轮约 4 亿元；代谢稳定碳水化合物靶向配体专利（09-11 公开）—— 肝外递送的配体侧布局
siRNA 赛道口径	1 期到获批成功率约 64% ≈ 行业均值 5.7% 的 11 倍（二手源，与上版 Alnylam 自述 >60% 口径不一）→ 建议统一引「Alnylam 自述 >60%」并注明来源
RNASeek	上版已确认权重放 HF（`JoyXiangLab/rnaseek-full`）；本轮 bioRxiv full-text 上线（`10.64898/2026.09.24.754173`），三段式 pretrain→predict→GRPO 细节完整，仍是与 caiPro 结构同构度最高的可参考样板

项	内容
规模	14 个遗传扰动数据集（scPerturb + Zenodo / Figshare / GEO），覆盖 9 项研究、10 种细胞系、激活 + 抑制扰动；18 个指标
核心机制	提出插值重复基线（`μ_i,ID = α⊙μ_i,TD + (1−α)⊙μ_all`，`α = 1−PDEGs`）作阳性对照、均值基线作阴性对照，定义动态范围分数 DRF 度量指标能否区分阳/阴对照
结论 1	常用指标（MSE、Pearson Δctrl）经常未校准，对真实模型性能不敏感
结论 2	加权类 / 排序类指标校准更好：WMSE、加权 R²Δ、归一化逆排序（NIR）
结论 3	在校准指标下，scGPT、GEARS、PRESAGE、scLambda、CellFlow 等多种 DL 模型都能超越无信息基线
防泄漏	每个扰动的细胞固定拆成「真值半 / 技术重复半」
泛化 / 下游	Replogle22 K562、Nadig25 HepG2（未见单扰动）；Norman19、Wessels23（未见组合）；通路富集 + KNN 图秩偏重叠（RBO）

项	结果
九个文本类科学基准（4,531 题 / 100 匹配档案）	平均准确率差 −0.6 pp（95% bootstrap [−1.5, +0.2]），无一基准呈现统计显著提升
token 与成本	匹配档案产出 1.5–2.3 倍 token，每次成功调用贵 2.2–4.5 倍
60 道工具调用型 BioMysteryBench 生信题	有档案 46.7% vs 基线 56.7%，差 −10.0 pp（95% [−16.7, −3.3]），主因是更频繁触发 token/时间上限
唯一的意外优势	SuperGPQA 上 provider 掉线时，短基线首次通过仅 54.0% vs 长档案 71.6% —— 但作者指出这来自长度/格式而非领域专业性

岗位	薪资 / 地点	关键要求原文
AI 算法专家（化学方向 AIDD）	30–50k × 14 薪 / 北京 / 5–10 年 / 博士	主职责含「规划多模态分子/反应表征、预训练、多任务学习和任务微调方案」「基于 LLM/Agent 整合 AI 模型、CADD/计算生物学工具、专家知识库与研发流程，建设 Copilot 能力」「规划并建设模型训练与推理平台及 MLOps 机制，覆盖数据与模型版本管理、实验追踪、评估、部署、在线/离线推理及运行监控」「系统评估模型的准确性、泛化能力、鲁棒性、可解释性和适用边界，并以可量化的业务价值或实验结果作为项目验收依据」
AI / ML 算法专家（AI4S / AIDD）	40–65k / 北京 / 5 年+	「参与论文、开源项目及技术成果建设」进岗位职责；要求「在顶级会议期刊发表过有影响力的研究成果，或参与过有影响力的开源项目」
AIDD 研究员（丽珠，09-29）	12–20k / 珠海 / 硕士	传统 CADD 为主（PyMOL / AutoDock / MOE / Gromacs + DeepChem），「了解 GNN、Transformer」
扬州某 AI 算法工程师	未标 / 1–3 年 / 本科	对照岗：模型压缩、推理加速、Docker、量化/剪枝 —— 工程化要求在低线城市岗位里也已标配
猎头岗（AI4S 方向）	40–65k	明确 Foundation Model / Generative AI / Diffusion / Transformer 在 AI for Science / AIDD 的应用

维度	命中	趋势
干湿闭环 / 数据-模型-评估-实验反馈迭代	4/5	连续第 12 轮 ≥80%
可复现工作流 / MLOps / 平台工程	3/5	上版 4/5，仍在高位，已从加分项稳定进主职责
评测体系 / 误差分析 / 适用边界	3/5	上版 3/5，持平
AI Agent / LLM 整合	2/5	上版 3/5
结构预测	2/5	—
开源项目 / 论文成果（新增维度）	2/5	首次进入岗位职责
核酸 / siRNA	0/5	连续第 3 轮算法岗缺席（与 §7 产业侧火热形成背离）

#	优先级	动作	依据	成本
1	P0	给 caiPro 的排序指标做一次 DRF 式校准：构造「技术重复基线（阳性对照）+ 均值基线（阴性对照）+ 插值基线」，算每个指标的动态范围分数；MSE / Pearson Δ 先标为「未校准」，改用 WMSE / 加权 R²Δ / NIR	Nature Biotech 10-01：同一批模型在未校准指标下输给基线、校准后赢	<1 人日，本轮最高性价比
2	P0	agent 层若已上或计划上：长 system prompt 改为按需检索片段；所有 agent 输出跑 ≥3 次报方差；禁止用过程分当验收标准	Scientific Agents（−10.0 pp / 贵 2.2–4.5×）+ BIABench（同一 agent 重复运行方差 > agent 间差异）	半天
3	P0	把现有「枚举+打分」管道里的复合步骤拆成单引擎单工具，每个边界落可审计中间产物	Protein Design MCP v2：`design_binder` 把 target 链当 design 返回，输出是合法 PDB 所以从外面看不见	1–2 人日
4	P1	无结构路线评估：如果 caiPro 未来要接「靶点可成药性 / 序列-化合物关联」，优先建序列 ↔ 实测读数的直接映射，别先上结构预测	Ptarmigan-1（跳过折叠，5000×）+ GuideFlip（结构在设计中涌现）	评估 1 天
5	P1	GuideFlip 值得直接下下来跑（MIT + 177 个 IDP 候选库已放）。它的「每步重预测、让当前状态影响下一步」是可迁移到序列设计的推理时框架	§2.2	半天起
6	P1	论文/方案可引的三句：①Nature Biotech「问题在指标不在模型」②Ptarmigan-1「可成药的前提从『有没有结构』改为『有没有相互作用映射』」③张健组「分子设计正从统计相关走向物理机制」	§2.1 / §4.1 / §3.3	0
7	P1	把「开源项目 / 论文成果」写进能力栈目标 —— 本周首次进 JD 主职责（40–65k 岗）	§8	长期
8	P2	数据合规台账对标「三权分置」：内部数据集要能说清持有权 / 使用权 / 经营权分别落位，来源授权链条完整	国家数据产权登记制度（§6.2）+ 上版安徽/湖北口径	1 人日
9	P2	昇腾路线可正式评估：DeepSeek 六件套已把算子栈铺平（DeepGEMM BF16 99.8% 硬件上限），但必须用真实负载复测，不能信微基准	§3.1	评估