定位：不重写全景。以 09-22 版为基线做 diff：先回执上版追踪项，再补本轮新增硬事实，最后落到生信岗位可执行动作。
检索窗口：2026-09-16 → 09-23（中英双语，freshness d3/d7/m1，共 10 轮）。
| # | 判断 | 依据强度 |
|---|---|---|
| 1 | 开源已经从"发布物"变成"基础设施商品"。 09-22 一手：OpenFold3（Apache-2.0）已被 NVIDIA BioNeMo 与 AMD Inference Microservices（Vultr 市场） 打包成开箱即用的推理微服务，MindWalk 在 MI325X 上实测 抗体-抗原推理约 5× 提速、分钟级起生产环境。09-21 RetroChimera（Nature，MIT）把逆合成也开源了。结论：模型不再是稀缺品，稀缺的是工作流编排、私有数据回路与实验通量。 | 高（厂商公告 + 顶刊） |
| 2 | RetroChimera 是本轮最硬的开源，但 "90%" 必须打折引用。 Microsoft Research + GSK + Novartis，Nature 2026-09-21，MIT，GitHub + Foundry。架构 = R-SMILES2（Transformer 从头生成前体）+ NeuralLoc（GNN 选模板并定位）+ 学习的排序层（rank-dependent voting）。硬数字是全路线完成数 9/10，而子模型 5/10、4/10、NeuralSym 2/10；"90% 专家接受率"是 n=10 的化学家偏好投票，不是湿实验成功率，且对照组是它自己的子模型（消融伪装成横评）。 | 高（论文一手 + 独立批评） |
| 3 | BindCraft2 发布（09-21，代码当天全开，学术 + 工业免费）。 Pacesa Lab。10 类结合剂模态统一进一套配置：de novo/large binder、线性肽、环肽、VHH、scFv、Fab、ankyrin repeat、同源多聚体、多结构域；靶点侧首次支持 IDR / 短线性基序 / 裸序列；最亮的是 多靶优化 + 主动 detargeting（负权重靶点把 binder 推离）。⚠️ P1：它不是标准 OSI 许可证 —— 免费内部使用，但禁止未经授权的第三方托管 / managed service / SaaS。 | 高（官方仓库 + 多篇实测） |
| 4 | Anthropic × Adaptyv 蛋白质设计竞赛：中国团队被明确排除在 Track 1/2 之外。 09-28 → 10-31，每周一题共 5 题（物种交叉反应性、pH 敏感性、肽-MHC 特异性、GPCR 等）。$100 万湿实验 + $100 万 Claude credits（学术 ≤5 万/产业 ≤2.5 万，约 20 队）+ Modal ≤25 万算力 + Twist 供 DNA；>5000 个设计在 Proteinbase 全部公开，含阴性结果（实验 11-30 前完成，数据 12-15 发布）。Track 3 面向所有人、不限模型、不受国籍限制 —— 国内唯一通道，且 09-28 开赛，没有准备时间了。 | 高（多源 + 申请表原文截图描述） |
| 5 | TorchX 数字补齐到可直接引用的粒度，上版许可悬案彻底解决。 官方技术长文给出全对比：FoldBench-AB TorchFold 70.1% / OpenDDE 62.4% / Protenix-v2 59.9% / AlphaFold3 46.5%；DockQ>0.8 高质量界面 TorchFold ~33% vs AF3 ~21%；ipTM≥0.8 时 98.3% 预测达 DockQ>0.23。TorchScore 比完整生成 约 100× 快，ipTM–DockQ Pearson 0.869。BLI 实测 K_D：迷你蛋白 IFNAR2 60.2 nM / IL-7Rα 8.55 nM / PDGFRβ 2.04 nM / PD-L1 23.3 nM；VHH BHRF1 24.3 / EFNA5 122 / PDGFRβ 268 / S100A4 354 nM。GPU 版在仓库 main 分支，与 NPU 版同为 MIT。 唯一未落地仍是 70.1% 的第三方复现。 | 高（官方技术文 + 多源） |
| 6 | 本轮抓到一条明确的假新闻链，必须点名。 多个低质站点称「OpenAI 于 2026-09-22 发布 GPT-Rosalind」。事实：OpenAI 官方 PDF《Biodefense in the Intelligence Age》明确写 GPT-Rosalind 于 2026-04-16 发布，2026-09-11 起对合格机构全球开放（仅 ChatGPT Enterprise / Codex / API 的受控访问，非公开 API，且 API 不对面向客户的产品开放）。日期被凭空推迟 5 个月。 这是继 AISB"开源 OpenFold3"之后第三条同类失真链 —— 规律已稳定：生命科学 AI 的中文与低质英文内容农场正在批量伪造"发布日 + 开源"标签。 | 高（OpenAI 官方 PDF 反证） |
| 7 | RNA 侧本轮实质供给增加，且资本进场。 ① NucleicBERT（KIT + 于利希，Nat Mach Intell，~3000 万条 RNA 预训练，单序列即可预测互作区域/二级结构/突变效应）；② EVA（上海交大 GENTEL-lab，MoE + 8192 token 长上下文，1.14 亿条全长 RNA，9 个基准 7 个 SOTA，全开源）；③ 勃林格殷格翰 × Envisagenics 超 10 亿美元 RNA 剪接靶点合作（SpliceCore，>1400 万剪接事件；其自研管线 ENV-375 是 ALS 的 ASO）。→ 对 siRNA 方向："AI 在 RNA 层找靶点"正在被大药企定价。 | 高（期刊/仓库/公司公告） |
| 8 | 岗位侧出现明确新信号：benchmark 严谨性从"加分项"升级为"主职责"。 上海徐汇 AIDD 算法与计算科学家（35–60k）把 时间切分 / 序列同源性切分 / 结构相似性切分 / 数据泄漏检查 / 置信度校准 / 不确定性估计 / prospective validation 逐条写进职责；另有 JD 把「熟悉 AI Agent 并应用于数据分析、模型开发、文献调研或药物设计」列为加分项。"会跑模型"已经不够，"会证明模型没骗你"开始被单独付钱。 干湿闭环本轮 5/5 全中（连续第六轮 100%）。 | 高（JD 原文） |
| # | 上版追踪项 | 状态 | 本轮结果 |
|---|---|---|---|
| 1 | TorchX 70.1% 第三方复现 | 未变（第 3 轮 0） | 仍无第三方复现。但官方放出完整技术长文，所有对比数字可引用（见结论 5）。★ 附带解决：GPU 版在 github.com/Mingchenchen/TorchX main 分支，与 NPU 版同 MIT —— 许可悬案关闭。 |
| 2 | Bepirovirsen FDA PDUFA 10-26 | 未变 | 无新一手。日本 08-24 获批仍是最新状态。 |
| 3 | VCC 终测 10-22 / 截止 11-05 | 部分 | 新增第二来源复述 2025 首届成绩：冠军百图生科 xTrimoSCPerturb（BM_xTVC）、Altos Labs 通才奖（flow matching PRiMeFlow）、第三名 TransPert 基本是统计方法（伪 bulk + Wilcoxon）；主办方结论「模型未在所有指标稳定超越朴素基线」。2026 届 8 月底近 300 队提交。⚠️ 新口径冲突：该来源称"百曜科技创始团队参与构建的扰动模型预赛全球第一、决赛全能榜第二"，与上版"天府锦城实验室彭玺 XLearning Lab 第二"归属打架。 |
| 4 | Anthropic 36 套件独立复现 | 未变（第 5 轮 0） | 仍 0 篇。本轮补齐仓库结构细节：36 个 kit 覆盖 AF3（JAX 与 Torch 双实现）、Boltz-2、OpenFold3、ColabFold、ESM C、RFdiffusion3、Chai-1、ESMFold2 等；四模式 off/exact/fast/big；共享 FlashPairformer + 三角注意力/三角乘法 kernel；每个 kit 提供 Docker / Apptainer / pinned venv 三路可复现环境，配置卡按 GPU 选（--config h100）。按既定规则：10 月底仍 0 篇则降级为"工程参考"。 |
| 5 | 7.87 亿美元融资归属 | 未变 | 本轮未获一手澄清。 |
| 6 | bioq 实测（macOS） | 移出 | 连续两轮未检。按规则移出追踪位，仅保留在 09-22 档案中作为候选工具。 |
| 7 | 十五五专栏 6 配套细则 | 部分 | 拿到官方解读口径：全文 14 处提及 AI，首次将"AI 制药"列入医药工业五年规划重点任务；专栏 6 五项场景（智能靶点筛选与药物发现 / 智能制药与质量管理 / 智能医药使用及健康管理含数字孪生与虚拟患者模型 / 智慧监管 / 智能真实世界研究）。新增关联文件：工信部等七部门《医药工业数智化转型实施方案（2025—2030 年）》—— 到 2027 年打造 100 个以上数智应用场景、建成 100 个以上数智药械工厂。 |
| 8 | ICH S13 制定进展 | 未变（第 3 轮） | 无更新。 |
| 9 | SA1211 / MWX205 / FB7011 首个临床数据 | 未变 | 无公开数据。 |
| 10 | JD「AI Agent 部署」是否成 Q4 标配 | 部分验证 | 本轮 5 条 JD：干湿闭环 5/5；结构预测 AF3/Boltz-2 3/5；AI Agent 2/5（1 条进主职责加分项、1 条平台岗隐含）；核酸序列优化 1/5（Oricell 香港，最贴近 siRNA）。判断：Agent 仍在"加分项"位置，尚未成为硬门槛；但 benchmark 严谨性已进主职责（见结论 8）。 |
| 11 | O3DC 口径冲突官方澄清 | 未变 | 无澄清。 |
| 12 | AISB / 失真监测 | ★ 触发 | 本轮抓到 GPT-Rosalind 日期伪造（结论 6）。失真已从"国内券商研报"扩散到"英文 AI 内容农场"。 |
| 13 | 药监局监管配套 | 部分 | 国家药监局近期表态：推进药品试验数据保护制度落地，建立儿童药品、罕见病用药市场独占期；完善早期研发沟通交流、对新靶点新机制创新药加强前置指导；拓展医疗器械临床创新成果转化"春雨行动"。 |
| 14 | 阶跃 Step 5 完整权重 10-15 | 未到期 | 时间窗未到。 |
统计：解决 1（TorchX 许可）· 部分 4（VCC、十五五、JD、监管）· 未变 7 · 移出 1（bioq）· 触发 1（失真监测）。
规律延续（第六轮）：带硬日期的承诺（发布会、PDUFA、终测日）→ 会兑现或可核对；无硬日期的"计划开源/论文待投/厂商自评" → 回执仍近 100%「没有」。建议已固化：只给带硬日期的承诺留追踪位。
A1. RetroChimera —— 逆合成路线规划（Nature，MIT，2026-09-21）
| 项 | 内容 |
|---|---|
| 来源 | Microsoft Research AI4Science + GSK + Novartis，Nature 在线优先 2026-09-21（Crossref 时间戳 15:02:15 UTC） |
| 组成 | R-SMILES 2（Transformer，从头写前体，自由但会幻觉） + NeuralLoc（GNN，选反应模板并决定施加位置，稳但受模板库限制） + 学习式排序层（rank-dependent voting，两模型给出同一反应时加权） |
| 硬结果 | 10 个困难靶点：RetroChimera 完成 9 条完整路线，de novo 子模型 5 条、模板子模型 4 条、NeuralSym 基线 2 条 |
| 软结果 | 专家盲评：完整路线接受率 90%，子模型/基线 20–50%；PhD 级化学家在成对与单点评测中更偏好它的切断，超过文献记载反应 |
| 泛化 | 在"两家大型药企"内部数据上做零样本迁移 + 微调，均报告稳健 |
| 开源 | GitHub（MIT）+ 权重/checkpoints + Microsoft Foundry 部署路径 |
| ⚠️ 必须打折 | ① n=10，90% 是偏好投票不是合成成功率；② 对照是自己的子模型 + 老基线 NeuralSym，本质是消融；③ 官方自认存在幻觉反应、分布外靶点、需专家复核；④ 读数是微软自家博客（利益相关方），论文付费墙 |
A2. BindCraft2 —— 结合剂设计"一套配置打十种模态"（Pacesa Lab，2026-09-21 代码当天全开）
| 维度 | 内容 |
|---|---|
| 模态 | de novo miniprotein / large binder / 线性肽 / 头尾环肽 / VHH / scFv / Fab / ankyrin repeat / 同源多聚体 / 多结构域 |
| 靶点 | 结构化域（PDB/mmCIF，可选链与表位）+ IDR 与短线性基序（FASTA 共折叠稳定 motif） + 裸序列 |
| 关键新能力 | multi-target optimization：正权重靶点轮换拉近（跨物种交叉反应/多特异）+ 负权重 detarget 把 binder 推离；表位控制 hotspot / coldspot / forced targeting（"lysine trick"）；构象目标 induced fit 与 fold switching |
| 可开发性前移 | humanization（降 MHC-II 锚定代理分）、protease stable、disulfide staple、mixed topology、termini together / accessible |
| 管线 | AF2 梯度幻觉（screen→refine→anneal→harden→mutate，分阶段早停）→ ProteinMPNN 重设计（默认 10 条）→ 独立 held-out AF 模型从零复折叠 → 按 i_pDAE 排序 |
| 工程 | 自建集成引擎，比 v1 快很多；不依赖 PyRosetta；Python ≥3.12 + NVIDIA GPU；实测 RTX 5090 一次装通（JAX/CUDA 无折腾）；Adaptyv / Ariax / Tamarind 托管 + 官方 Colab，无 GPU 也能跑 |
| 上手 | git clone https://github.com/PacesaLab/BindCraft2 → bash install.sh → bindcraft design examples/pdl1.json；examples/ 有 22 个现成 JSON（含 pdl1_detarget_pd1.json、pdl1_ortholog_pair.json、dynorphin_idr.json、pdl1_fold_switching.json 等） |
| 诚实边界 | 只做纯蛋白-蛋白，不计配体/PTM/小分子/核酸；只用天然氨基酸；排序反映"结合概率"不是亲和力；i_pTM/i_pDAE/pLDDT/PAE ≠ K_d/k_on/k_off；现实仍要筛 2–20 条湿实验；10%–100% 命中率来自 v1 的 Nature 论文，不能写成"BC2 的 VHH/Fab/环肽也达到" |
| ⚠️ P1 许可 | 不是标准 OSI 开源许可：学术 / Biotech / 药企可免费内部使用，但限制未经授权的第三方托管、managed service 与 SaaS。上生产或对外服务前必须读 LICENSE |
A3. OpenFold3 被芯片厂做成微服务（2026-09-22 一手）
A4. ScienceIDE —— 把科学代码库变成智能体可学环境（AItonomy + PhAI Labs + 阿里 Qwen，2026-09-16/17）
| 项 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 27 个科学代码库（MITgcm、Athena++、PLUTO 等）→ 64 个环境 → 2812 个任务（几乎全是 repair / implementation）+ 1076 个可执行数值校验 |
| 判分逻辑 | 注入缺陷或挖空函数体 → 重编译 → 跑物理算例 → 与参考数值比对。奖励锚点是"算出来对"，不是"代码长得像"（diff-match） |
| 模型 | PhAI-IDE-72B / 9B / 4B（Qwen 基座），4B 与 9B 权重 Apache-2.0；9B 在 LAPS 等离子代码 held-out 通过率 31.25% → 50%，RL 后 held-out reward 0.357 → 0.857 |
| 硬评测 | ScienceIDE-Hard：85 道无提示 1 小时任务，最强智能体 Claude Fable 5.1 只解出 67.1%，15 个被测智能体中 11 个低于 40% |
| 开源度 | 已发布 15 个环境；github.com/aitofound/ScienceIDE；底层基建在 Gen-Verse/ScienceInfra；⚠️ 自有代码与任务元数据的许可证要等完整发布才公布；完整数据与源码尚未全放 |
A5. 其他开源条目（补录）
10.64898/2026.09.16.751194，国内团队，国家重点研发计划）：无 MSA 的 ESMFold2-Fast（3 recycle）在 FoldBench 上 57% acceptable-or-better DockQ，可比 AF2-Multimer 但算力低一个量级；PAE 引导的结构域切分保留 98.1% 的 XL-MS 交联；再加正交组学证据重排序（SPOC），AUROC 0.87→0.93、AUPR 0.79→0.90；1:128 正负比下 5% FDR 处召回 17.2%。→ 这是"结构预测 + 你已有的实验数据"低成本提分范式，值得 caiPro 照抄。github.com/GENTEL-lab/EVA。10.64898/2026.09.16.752260）：UniProt-complete 病毒蛋白结构库升级。Anthropic × Adaptyv 全球蛋白质设计竞赛（完整赛制）
| 项 | 内容 |
|---|---|
| 时间 | 2026-09-28 → 10-31，每周发布一道题，共 5 题；申请窗口 09-16 → 09-24，入选通知在 09-28 前 |
| 题目方向 | 物种交叉反应性、pH 敏感性、肽-MHC 特异性、GPCR 等高难靶点类型（截至 09-23 五题均未公布） |
| 资源 | 湿实验验证 $100 万（Anthropic + Adaptyv 共资）；Claude credits 最多 $100 万（学术 ≤5 万、产业 ≤2.5 万，约 20 队）；Modal 算力 ≤$25 万；Twist Bioscience 供 DNA |
| 三个赛道 | Track 1（实验室/公司，湿实验支持最多，每挑战约 18 个设计名额）· Track 2（个人或 ≤3 人小队，Claude Max 20x 免费 + Modal ≤$500）· Track 3（所有人，Adaptyv 管理，不受 Anthropic 资助、不限模型） |
| 硬约束 | Track 1/2 必须"使用 Claude 进行设计" 才能拿资助；⚠️ Track 1/2 申请表明确列出无法申请的国家和地区，中国在列 |
| 数据出口 | >5000 个设计在 Adaptyv 自动化实验室合成与表征；序列、预测结构、设计方法、测量结果（含阴性结果）全部在 Proteinbase 公开；实验 11-30 前完成，数据 12-15 发布；无现金奖，实物奖待公布 |
| 判断 | 这是目前唯一一个有硬日期、有阴性结果公开承诺、规模 >5000 的干湿闭环数据集。12-15 的数据发布日 = 下个季度最值得盯的公开数据事件。 |
| 事件 | 数字与要点 |
|---|---|
| BI × Envisagenics | 多年期研究 + 选择权协议，总额 >10 亿美元（首付款 + 研究经费 + 选择权费 + 开发/注册/商业里程碑 + 销售分成）。SpliceCore 筛选 >1400 万剪接事件 预测疾病特异性/患者 prevalence/成药适配；BI 可用于 ADC、T 细胞衔接器、多特异抗体。Envisagenics 自研 ENV-375 是 ALS 的 ASO（临床前后期）；此前合作方 Biogen（CNS）、J&J 肺癌计划、BMS（2022）。 |
| BI × Owkin | 同月另一笔：BI 获得 Owkin K Pro AI 平台与肿瘤/免疫多模态患者数据访问权（说明 BI 在并行铺计算靶点发现）。 |
| AbbVie × Iambic | 免疫/神经/肿瘤 AI 药物发现合作（里程碑 + 分成）；Iambic 同期递交 IPO，推进 AI 设计的 HER2 抑制剂 IAM1363（实体瘤）。 |
| Insilico × 某基础模型实验室 | 生成式生物模型共同开发，金额"数千万美元级"，收入分成。 |
| Seek Labs Open Impact（CGI） | 三年计划，从 11 种被忽视传染病（裂谷热、基孔肯雅、乙脑、戊肝、寨卡、EV-A71、疫苗衍生脊灰、黄热、狂犬、小反刍兽疫、新城疫）中选 2 个；提供 BioSeeker 靶点情报 + Sequence Ablation Therapeutics（SAT） 设计与技术说明，无前期许可壁垒；BioSeeker 已覆盖 145 种疾病 ≈ 全球传染病负担 95%。 |
| A 股/港股反应 | 09-17 CRO 板块大涨（金石亚药、百花医药涨停）；09-19–20 贝瑞基因涨停、义翘神州/泓博医药/百奥赛图跟涨；隔夜美股 Absci +15%、Tempus AI +15%。机构口径：招商证券"AI 算力与湿实验验证共同构成 AI 制药基础设施"；东吴"算力/模型/数据/资本四维并进"；中泰"具备高质量数据 + 自动化实验平台 + 产业客户基础的上游与 CXO 持续受益"。 |
| 国产算力 | 华为全联接大会 2026（09-17~18）：全球首个 NPO（近封装光学）昇腾 960 超节点，单节点 4096 卡，5500 个 Hi-ONE 单元替代传统 4.8 万颗 800G 光模块，整系统功耗降 >550 kW，可用度 99.8%；灵衢昇腾 950 智算集群 09-30 国内商用、11-30 海外。汪涛：参数规模向 10 万亿级迈进，2030 有望破 100 万亿；国内日均推理 Token 已达 500 万亿。华为智算实验室方案已落地 230+ 机构（与 TorchX 同源生态）。 |
| AI 临床管线口径 | 本轮再出现"全球 AI 驱动新药临床管线 179 个、9 个进入 III 期"（与上版 173/15 冲突，第 3 轮未收敛）。 |
| 岗位 | 地点/薪资 | 关键信号 |
|---|---|---|
| AIDD 算法与计算科学家 | 上海徐汇 35–60k | ★ 把 benchmark 严谨性写进主职责：时间切分 / 序列同源性与结构相似性切分 / 外部测试集 / 数据泄漏检查 / 置信度校准与不确定性估计 / prospective validation；另要求"ML-ready 数据集 + 数据版本 + 标签定义 + 实验批次管理 + 数据质量评估"与"可复现批量计算/任务调度/实验追踪/模型版本" |
| AIDD 研究员（小分子） | 1.5–3 万 | 干湿闭环；GNN/扩散/Transformer；加分项：熟悉 AI Agent 并能用于数据分析、模型开发、文献调研或药物设计流程优化；另加分项：分子胶经验、AIDD 平台/自动化流程/内部工具开发 |
| AIDD 科学家（多肽） | 长沙 25–35k×14 | 博士；多肽大模型；"干湿一体的多肽药物研发" |
| Senior Scientist, AIDD（Oricell） | 中国香港（09-17） | 最贴近 siRNA：核酸序列优化、密码子、二级结构、mRNA 稳定性/翻译效率/免疫原性预测、合成启动子与动态响应开关、基因编辑与非病毒递送；要求 ESM/AF3/ProteinMPNN 微调经验 |
| AIDD 化学信息工程师（泓博医药） | 上海浦东 20–30k×13 | VAE/GAN/Diffusion；Markush 结构提取与 PCC 分析；GPU/显存管理 |
共性（连续第六轮）：干湿闭环 5/5；结构预测 AF3/Boltz-2 3/5；AI Agent 2/5（仍处加分项）；核酸方向 1/5。
| 级别 | 事项 | 后果 | 建议动作 |
|---|---|---|---|
| P0 | Anthropic×Adaptyv 竞赛 Track 1/2 明确排除中国团队（申请表中列明）；Track 3 不受限 | 国内团队拿不到免费湿实验名额（每挑战 ~18 个设计）与最高 5 万美元 Claude credits，也拿不到那批"入选队专属"的实验数据 | Track 3 是唯一通道，09-28 开赛。今天就要准备设计管线与提交格式；同时把 12-15 Proteinbase 数据发布标进日历 —— 那是免费的 5000+ 带阴性结果的湿实验数据集 |
| P1 | GPT-Rosalind "2026-09-22 发布"为伪造日期（实际 2026-04-16 发布、09-11 全球开放、受控访问非公开 API） | 二次引用会污染时间线与竞品判断；这类内容的变体已在中文与英文低质站扩散 | 引用 OpenAI 生命科学模型时只认 openai.com 一手 PDF/公告；见到"某日发布"先查 Crossref/官方 blog |
| P1 | BindCraft2 不是标准 OSI 许可：免费内部使用，但禁止未经授权的第三方托管 / managed service / SaaS | 直接集成到对外平台或商业化服务可能违约 | 上生产前逐字读 LICENSE；内部研究可放心用；对外服务先联系 Pacesa Lab |
| P1 | RetroChimera "90%" 的 n=10 与自比基线问题；读数来自利益相关方博客，论文付费墙 | 把它写成"逆合成 90% 准确率"是错的；真实可用结论是"9/10 vs 5/10 vs 4/10 vs 2/10 的路线完成数" | 内部要上就自建 ≥50 靶点的化学家盲评，别引用 90% |
| P1 | 晶泰 Kodexia 相关内容为批量 SEO 生成：同一段"超过 70% 的测试中优于传统模板""突破专利封锁有望 FTO"文字在至少 4 个不同域名重复出现，无一手论文/数据集 | 引用这类数字等于引用广告文案 | 暂不引用；如需国产 siRNA AI 平台信息，改引公司公告/年报 |
| P2 | VCC 2025 亚军归属冲突：上版"天府锦城实验室彭玺 XLearning Lab 第二" vs 本轮"百曜科技创始团队参与模型预赛第一、决赛全能榜第二" | 影响国内团队成绩表述 | 引用时写"中国团队在多个维度进入全球前三"，不点具体名次归属 |
| P2 | AI 临床管线 179/9 vs 173/15（第 3 轮未收敛） | 报告口径不一致 | 引用时写"约 170–180 条、III 期不足 15 个"并注明来源分歧 |
| P2 | 市场预测 $2.33B→$6.62B（CAGR 29.8%）来自 The Business Research Company，无方法论 | 投行式数字 | 不单独引用，需交叉第二来源 |
| P2 | MindWalk 5× 提速为厂商自评、非标准 benchmark、特定配置 | 不能直接当 OpenFold3 通用性能结论 | 仅作"微服务化已可用"的证据，不作性能证据 |
| 优先级 | 动作 | 理由与预期收益 |
|---|---|---|
| 本周 | 装 BindCraft2 跑冒烟测试（Python 3.12 + conda，RTX 5090 实测一次装通；bindcraft design examples/pdl1.json，看 3_Ranked/!_Ranked.csv 有无产出） | 门槛最低的"设计相互作用"入场券；22 个现成 JSON 覆盖 detarget / ortholog pair / IDR / fold switching。若 caiPro 有蛋白结合剂或环肽需求，这是本周就能出候选的路径 |
| 本周 | 读 BindCraft2 的 LICENSE 全文，确认内部使用 vs 对外服务的边界 | P1 风险未确认前不要进任何对外产品 |
| 本周 | 登记 Anthropic×Adaptyv Track 3（09-28 开赛，不限模型、不限国籍） | 唯一能拿到免费湿实验验证的公开通道；即便不参赛，12-15 的 Proteinbase 数据是必抢资产 |
| 2 周内 | 用 RetroChimera 做一次内部逆合成比对（MIT 可商用），自建 ≥50 靶点盲评 | 若你所在项目涉及小分子合成可行性，这是本轮唯一的顶刊级开源；但不要引用 90% |
| 2 周内 | 把 SPOC-ESMFold2 的思路移植到 caiPro：结构/序列特征 + 正交实验证据重排序 | 它只靠"加一层正交证据"就把 AUROC 从 0.87 提到 0.93。对 siRNA 效力/脱靶排序是同构问题——把已有的实验测定的脱靶、表达量、组织数据当正交证据接进排序层，可能比换模型更划算 |
| 2 周内 | 用 RNATx-Bench（RNAGenesis）当 siRNA 活性预测的评测床；同时评估 EVA / NucleicBERT 作为 embedding 源 | 本轮 RNA 侧三个新供给合起来正好补上 caiPro 的"表示 + 评测"两块；但必须先做 leakage-aware split |
| 持续 | OpenFold3 走微服务（NVIDIA BioNeMo 或 Vultr AIMs），别再自建 MSA 基建 | 分钟级起生产环境，把工程成本转给云厂商 |
| 简历/能力 | 把 "benchmark rigor" 写成显式技能条目：时间切分、同源性/结构相似性切分、数据泄漏检查、置信度校准、不确定性量化、prospective validation | 本轮 JD 已把它从加分项升级为主职责（35–60k 岗位逐条列明） |
| 避坑 | 不引用：晶泰 Kodexia 系列 SEO 文案、"OpenAI 09-22 发布 GPT-Rosalind"、AUC 0.913 = 准确率 91.3% | 三条本轮实证的失真链 |
1. Anthropic×Adaptyv 竞赛 09-28 开题（五题内容、Track 3 提交格式） 2. TorchX 70.1% 第三方复现（第 4 轮，唯一未落地项） 3. VCC 终测 10-22 下发 → 11-05 截止 → 11 月中下旬结果（看榜首能否显著高出 0.2629） 4. Bepirovirsen FDA PDUFA 10-26（连续两轮无更新） 5. Anthropic 36 套件独立复现（第 6 轮 0；10 月底仍 0 则降级为工程参考） 6. Proteinbase 数据发布 12-15（5000+ 设计含阴性结果） 7. BindCraft2 论文预印本 + LICENSE 正式文本（当前"代码先发、论文后补"） 8. RetroChimera 第三方评测（n>10 的化学家盲评或湿实验） 9. ScienceIDE 完整发布与许可证（当前自有代码许可未公布） 10. 国内 siRNA 双靶管线首个临床数据：SA1211 / MWX205 / FB7011 11. ICH S13 制定进展（第 4 轮） 12. 阶跃 Step 5 完整权重 10-15 是否兑现（时间窗临近）
本简报为 09-22 版的增量 diff。所有数字均标注来源强度与已知口径冲突；凡"厂商自评 / 论文待投 / 计划开源"类信息，按既定规律默认降权处理。